Naqvi, yüksek lisansını Yale Üniversitesi’nden (1961) ve Princeton Üniversitesi’nde (1966), post-doktorasını ise Harvard Üniversitesi’nde (1971) yaptı. Ekonominin farklı yönleri üzerine çok sayıda makale, kitap ve monograf yayınlanan Naqvi, bugüne kadar Quid-e-Azam Üniversitesi, Pakistan Kalkınma Ekonomisi Enstitüsü, Asya-Pasifik Gelişim Merkezi, Birleşmiş Milletler Alt Bağlantı Projesi gibi bir çok çalışmada akademik ve politika yapıcı pozisyonlarda bulundu. 1991 yılında Pakistan Cumhurbaşkanı tarafından İktisat Biliminde Sitara-eI mtiaz ödülüne layık görülmüş ve 1992 yılında İstanbul Devlet Başkanları Zirvesi Toplantısı’nda ekonomi alanında seçkin çalışmalar yaptığı için ECO ödülüne layık görülmüştür. Ayrıca uzun ve seçkin akademik kariyerinden dolayı Aralık 2009’da Yaşam Boyu Akademik Başarı Ödülü’ne layık görülen Naqvi, hâlihazırda HEC Değerli Ulusal Profesör ve Federal Urdu Sanat, Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, İslamabad Genel Direktörüdür.